《数码宝贝格斗编年史》操作攻略游戏中主要分为单人模式、多人乱斗模式、练习模式等三种，单人模式中，玩家可以选择自己喜欢的数码宝贝，来进行关卡制的战斗，并可依照玩家所选择的分歧路径的不同而与历代卡通动画中所出现，各种不同的头目级强悍数码宝贝对决数码宝贝手机格斗版。
各种招式：↑：向上↓：蹲←：向左移动→：向右移动□：化学攻击△：跳（多数数码宝贝可连续跳两次，天使系的一直按，可以飞翔，花仙兽可连跳三次）○：举起东西×：连续物理攻击R1：进化键、必杀键L1：防御（除必杀技，↓×，超比多兽的蓄力，○外，其他的攻击均可防御）↑+□：向上物理攻击↓+□：平地物理攻击，有的可以一直按着连续攻击↑+×：轻型向上物理攻击↓+×：翻倒对手（用于破解对手的L1防御）↓+L1：坐蹲防御（用于抵御对手↓+×招式，除△+×，超比多兽的蓄力，必杀技，△+↓+×，○外，其他攻击均可防御）△+×：空中突击△+↓+×：高空急速下落攻击，用于大面积地面对手攻击，产生的大范围震波可震晕无防御对手，甚至破坏对手的必杀技，使其必杀技失效L1+□：蓄力攻击，按住这两键不放手，再无对手攻击自己的情况下，蓄力至极限，发出，可给予对手致命的伤害，其伤害值超过必杀技伤害值，可秒杀对手L1+×：恢复血量，按住两键不松手（在有能量值的前提下，使用此技能可以减去能量值，以一半的效果加成自己的血量），该技能存在BUG，使用此技能，可以使自己从眩晕中立刻醒来，或在被敌人打翻在地时立即站起，或是逃避敌人的×——连续物理攻击，若是对手连续攻击你，你无法脱身，使用此技能可以立即帮你醒来，注意：使用此技能时，若受到对手的攻击，将会有大量的能量球从你身上掉落，并且，自己血量会很快减少↓+↑+△：神圣天使兽、神圣天女兽独有技能，使用此技能可以帮你高高跳起，是普通数码宝贝一次跳跃高度的4倍数码宝贝手机格斗版。
